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p.337~339에 나오는 내용입니다.


 


apoptosis의 기원에 대한 내용이지요.


 


히드라충류(유성생식도 가능하고 무성생식도 가능한 세포군체)를 예로 설명하고 있습니다.


 


세포군체를 이루게 되면 세포군체에서 차지하는 위치에 따라 세포마다 먹이와 산소의 공급이 달라집니다.


 


먹이와 산소의 공급이 다르면 산화환원 기울기가 달라지지요.


 


세포의 분화는 산화환원 상태에 따라 조절되며 이 신호는 미토콘드리아에서 나옵니다.


 


이 중 먹이와 산소 공급이 모자르는 위치에 있는 개체는 자유라디칼 신호의 분출과 함께 독립적인 유성생식 신호를 보냅니다.


 


하지만 이 유성생식 신호는 개체에게는 유리할 지 모르지만, 세포군체 전체로 봐서는 불리합니다.


 


그래서 대의를 위해 유성생식 신호를 보내는 개체를 집단 차원에서 응징하는 것으로 apoptosis를 설명하고 있습니다.


 


여기서 의문입니다.


 


닉 레인은 apoptosis를 두가지로 구분하고 있습니다. (p.311)


 


외부 신호에 의한 apoptosis와 내부 신호에 의한 apoptosis이지요.


 


위의 예에서 설명하고 있는 것은 DNA 손상에 의한 apoptosis입니다. 즉, 내부 신호에 의한 apoptosis이지요.


 


외부 신호에 의하지 않고 자체적으로 apoptosis를 일으키는...


 


하지만, 내용의 흐름은 '외부 신호'에 의한 apoptosis입니다. 주변 개체들이 DNA 손상이 된 개체를 죽여버리는 것이지요.


 


앞뒤 내용이 맞지 않습니다.


 


그리고 한가지 더!!


 


세포군체는 분명 성긴 연합입니다.


 


주변 개체들이 DNA 손상 개체를 죽여버리려고 한다면,


 


DNA 손상 개체는 군체에서 탈락해 나와 독립하면서, 다른 독립 개체와 유성 생식을 하려드는 진화압력을 받게 됩니다.


 


세포군체 입장에서는 DNA 손상 개체가 죽어버리나, 탈락해나가나 별 차이가 없기 때문에 이를 막을 진화압력은 존재하지 않습니다.


 


즉, DNA 손상 개체가 세포 군체에서 독립해 나오는 시나리오가 더 설득력이 있어 보입니다.


 


'외부신호에 의한 apoptosis'를 받아들이지 않고 독립하려는 개체를 막을 방법이 뭐가 있을까요?


 


 


글을 기술하다 보니, 추가로 든 의문이 생겼습니다.


 


유성 생식의 진화를 '닉 레인'은 DNA 손상 세포가 손상 경향을 줄이기 위해 정상 세포와 유전자 재결합을 통해 손상을 희석시키려 한다는 것으로 설명하고 있습니다. 일리 있는 내용입니다.


 


하지만 반대 입장에서 보면, 정상 세포는 유전자 재결합이 불리한 행위입니다.


 


그러므로 정상 세포는 유전자 재결합을 하지 않으려 하는 진화 압력을 받습니다.


 


이 두가지 입장에서 군비 경쟁이 일어난다면, 유성 생식의 진화가 그리 쉽게 일어날 거 같지는 않습니다.


 


진화의 경향성이 DNA 손상 세포가 유리하도록 기울 수 있는 근거와 이유에 대한 설명이 추가되어야 할 것 같습니다.


 


세포는 분명 자신의 DNA가 손상되었는지, 그렇지 않은지 알고 있는 듯 합니다. 효모나 볼복스 카르테리(p.335)는 DNA 손상 유무에 따라 유전자 재조합의 선호 유무를 결정한다고 기술하고 있습니다.


 


그렇다면 분명 정상 세포는 그러한 행위를 막는 방향으로 진화 압력을 가질 것입니다.


 


반대 입장(정상 세포 입장)에서의 사유도 포함이 되어야, 설득력을 지닐 수 있을 듯 보입니다.

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    엄준호 2011.06.30 02:04
    1) 이일준님 글
    apoptosis의 기원에 대한 내용이지요.
    히드라충류(유성생식도 가능하고 무성생식도 가능한 세포군체)를 예로 설명하고 있습니다.
    세포군체를 이루게 되면 세포군체에서 차지하는 위치에 따라 세포마다 먹이와 산소의 공급이 달라집니다.
    먹이와 산소의 공급이 다르면 산화환원 기울기가 달라지지요.
    세포의 분화는 산화환원 상태에 따라 조절되며 이 신호는 미토콘드리아에서 나옵니다.
    이 중 먹이와 산소 공급이 모자르는 위치에 있는 개체는 자유라디칼 신호의 분출과 함께 독립적인 유성생식 신호를 보냅니다.
    하지만 이 유성생식 신호는 개체에게는 유리할 지 모르지만, 세포군체 전체로 봐서는 불리합니다.
    그래서 대의를 위해 유성생식 신호를 보내는 개체를 집단 차원에서 응징하는 것으로 apoptosis를 설명하고 있습니다.
    여기서 의문입니다.
    닉 레인은 apoptosis를 두가지로 구분하고 있습니다. (p.311)
    외부 신호에 의한 apoptosis와 내부 신호에 의한 apoptosis이지요.
    위의 예에서 설명하고 있는 것은 DNA 손상에 의한 apoptosis입니다. 즉, 내부 신호에 의한 apoptosis이지요.
    외부 신호에 의하지 않고 자체적으로 apoptosis를 일으키는...
    하지만, 내용의 흐름은 '외부 신호'에 의한 apoptosis입니다. 주변 개체들이 DNA 손상이 된 개체를 죽여버리는 것이지요.
    앞뒤 내용이 맞지 않습니다.

    1-1) 저의 견해
    전체적으로 내용을 잘못 이해하시지 않았나 생각됩니다.
    - 우선 저자는 산화환원신호가 대략 세 가지 기능을 한다고 설명하고 있습니다. 즉 세포 분화 유도, 유성생식 유도, apoptosis 유도
    - 먹이와 산소 공급이 모자란 곳에 있는 세포가 자유라디칼 신호를 분출할 수는 없습니다. 자유라디칼 분출은 먹이와 산소는 풍부한데 생산된 ATP를 처리할 수 없는 차지에 놓인 세포에게서 나타납니다. 예를 들어 DNA 손상으로 세포분열이 정지된 세포
    - 대의를 위해 손상된 세포를 제거한다는 표현이 나오지만(p338) 이것이 곧 외부신호에 의해 apoptosis가 일어난다는 뜻은 아닙니다. 오히려 저자는 내부신호에 의한 apoptosis에 대한 강한 선택압이 작용했다고 설명하고 있는 것 같습니다.
    외부신호 즉 death factor에 의한 apoptosis는 상당히 진화한 다세포생물에게서 나타난다는 것을 저자도 잘 알고 있을 것입니다.

    2) 이일준님 글

    그리고 한가지 더!!

    세포군체는 분명 성긴 연합입니다.
    주변 개체들이 DNA 손상 개체를 죽여버리려고 한다면,
    DNA 손상 개체는 군체에서 탈락해 나와 독립하면서, 다른 독립 개체와 유성 생식을 하려드는 진화압력을 받게 됩니다.
    세포군체 입장에서는 DNA 손상 개체가 죽어버리나, 탈락해나가나 별 차이가 없기 때문에 이를 막을 진화압력은 존재하지 않습니다.
    즉, DNA 손상 개체가 세포 군체에서 독립해 나오는 시나리오가 더 설득력이 있어 보입니다.
    '외부신호에 의한 apoptosis'를 받아들이지 않고 독립하려는 개체를 막을 방법이 뭐가 있을까요?
    글을 기술하다 보니, 추가로 든 의문이 생겼습니다.
    유성 생식의 진화를 '닉 레인'은 DNA 손상 세포가 손상 경향을 줄이기 위해 정상 세포와 유전자 재결합을 통해 손상을 희석시키려 한다는 것으로 설명하고 있습니다. 일리 있는 내용입니다.

    하지만 반대 입장에서 보면, 정상 세포는 유전자 재결합이 불리한 행위입니다.
    그러므로 정상 세포는 유전자 재결합을 하지 않으려 하는 진화 압력을 받습니다.
    이 두가지 입장에서 군비 경쟁이 일어난다면, 유성 생식의 진화가 그리 쉽게 일어날 거 같지는 않습니다.
    진화의 경향성이 DNA 손상 세포가 유리하도록 기울 수 있는 근거와 이유에 대한 설명이 추가되어야 할 것 같습니다.
    세포는 분명 자신의 DNA가 손상되었는지, 그렇지 않은지 알고 있는 듯 합니다. 효모나 볼복스 카르테리(p.335)는 DNA 손상 유무에 따라 유전자 재조합의 선호 유무를 결정한다고 기술하고 있습니다.
    그렇다면 분명 정상 세포는 그러한 행위를 막는 방향으로 진화 압력을 가질 것입니다.
    반대 입장(정상 세포 입장)에서의 사유도 포함이 되어야, 설득력을 지닐 수 있을 듯 보입니다.

    2-1) 저의 견해
    세포군체는 유전적으로 동일한 세포로 이루어져 있기 때문에 "유전자" 관점에서는 굳이 손상된 세포를 제거하지 않고 독립시킬 이유는 없을 것 같습니다. 오히려 원시 세포군체이지만 세포들이 다소 분화되어 있다면 손상된 세포를 빨리 새로운 세포로 대체하는 것이 유리할 것입니다.
    그리고 한 가지 더 "유전자 재조합"은 손상된 DNA와 정상 DNA를 섞어 DNA 손상 정도를 희석시키는 과정이 아닙니다. "유전자 재조합"을 통한 DNA 복구 과정은 정상 DNA를 주형으로 사용하여 말그대로 DNA 손상 부위를 복구하는 것입니다.
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    변정구 2011.06.30 02:04
    (미토콘드리아, 338페이지)

    앞서 이미 살핀 바와 같이 미토콘드리아는 굶주림 때문에 호흡에 필요한 전자가 부족하면 스트레스에 저항하는 신호를 내놓는다.
    We have already noted, for example, that a lack of respiratory electrons, due to starvation, generates a signal for stress resistance.

    세포군체에서는 손상된 세포가 다른 세포와 유성생식을 시도하면 세포군체 전체의 생존을 위태롭게 하며 혼란만 일으킬 뿐이다.
    In a colony, damaged cells that attempt to have sex with other cells are likely to jeopardize the survival of the colony as a whole—only chaos can ensue.

    결국 대의를 위해 손상된 세포를 선택적으로 제거하는 아포토시스를 일으켜 공동목표를 유지하고 개체의 진화를 향한 길을 닦았다.
    And in time, the selective removal of damaged cells for the greater good paved the way for the evolution of the individual, in whom common purpose is policed by apoptosis.

    따라서 감금된 미토콘드리아의 자유를 향한 외침이 한때 단세포 생물에서는 유성생식을 부추겼지만, 다세포 생물에서는 손상된 숙주세포와 더불어 자신의 죽음까지 초래하게 된 것이다
    So the cries for freedom of captive mitochondria, which may once have urged for sex in single cells, were met with death in a multicellular body—their own, along with their damaged host cells.
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    엄준호 2011.06.30 02:04
    1)
    => 저도 이렇게 이해하는 것이 맞다고 생각합니다.
    그런데, p.338에 보면, "앞서 이미 살핀 바와 같이 미토콘드리아는 굶주림 때문에 호흡에 필요한 전자가 부족하면 스트레스에 저항하는 신호를 내놓는다." 라고 기술하고 있습니다. 어떻게 이해하는 것이 좋을까요?

    ***답변
    먹이부족, 추위, 강한 자외선 등의 스트레스를 받으면 일부 생물들은 포자를 만들어 이 위기를 견디어냅니다. 아마 이와 관련된 신호도 미토콘드리아가 내놓는다는 의미인 것 같습니다. p331 참조


    2)
    => 여기서 기술되고 있는 시나리오는 해당 세포 이외의 세포들이 해당 세포를 죽이는 것으로 기술되고 있는 것 같습니다. 전 이것을 외부신호에 의한 아포토시스로 이해하고 있는데... 외부 신호에 의한 아파토시스를 어떻게 이해하는 것이 좋을까요?

    *** 답변
    일전에 말씀드린 바와 같이 제 견해로는 원시 다세포생물에서 apoptosis가 일어났다면 이는 내부신호에 의한 자발적 apoptosis가 아니었을까 생각합니다. 아시겠지만 현재 복잡한 구조를 가진 다세포동물에서는 예를 들어 면역 세포들이 온몸을 순찰하는 과정에서 문제가 있는 세포(손상된 세포, 병원균에 감염된 세포 등)를 발견하면 apoptosis를 유도하는 물질을 분비하여 문제 세포의 apoptosis를 유도합니다. 이와 같은 외부 신호에 의한 apoptosis 유도는 훨씬 나중에 생물의 몸 구조가 복잡해지고 정교해져 자발적인 apoptosis에만 의존하여 몸 전체의 조화를 유지하기 어려워졌을 때 진화되지 않았나 생각합니다.

    3)
    나머지 질문들은 종합해서 답변드려야 할 것 같습니다.
    물론 제 이야기가 정답이라고 하는 것은 아닙니다.
    “미토콘드리아”를 읽으면서 제가 이해한 바는,
    원시 다세포생물은 어느 정도 분화된 세포들을 가지고 있었을 것입니다. 그런데 이런 세포들이 DNA가 손상되었다고 너도나도 세포융합을 통한 유전자재조합을 시도한다면 몸의 여러 기능들이 제대로 수행되기 곤란할 것입니다. 이런 상황을 저자는 생존을 위태롭게 하며 혼란만 일으킬 뿐이라고 표현한 것 같습니다. 예를 들어 운동 기능을 담당하는 세포들이 DNA가 손상되었다고 자꾸 인접세포들과 융합하려한다면 일시적으로 운동기능은 물론 인접세포의 기능마저 약화될 것입니다. 이것은 분명 이로운 상황은 아닐 것입니다. 물론 이런 일시적 기능 교란을 생물이 충분히 감내할 수도 있습니다. 그렇다면 느긋하게 세포융합을 하고 유전자재조합을 통해 손상된 DNA를 복구하고 다시 세포분리를 통해 원래의 세포로 되돌아가면 됩니다. 그런데 제가 보기에 아마 많은 다세포생물들은 경제적 시간적 잇점 때문에 그냥 문제가 있는 세포는 제거해버리고 세포분열을 통해 새로운 세포를 생산하는 쪽으로 진화하지 않았나 추측해 봅니다.

    관련하여 사족을 좀 붙이면
    원시 다세포생물(세포군체)에서 손상에 의해 미토콘드리아에서 나오는 자유라디칼 신호는 이제 세포융합(이것이 곧 성의 기원이라 할 수 있음)을 통한 유전자재조합을 부르는 신호가 아니라 죽음을 부르는 신호가 되었습니다. 따라서 이제 원시 다세포생물은 몸을 구성하는 모든 세포들이 동의할 수 있는 생식방법을 찾아야 했습니다. 그 결과 생식기능 즉 세포융합 권리를 특정 세포에게만 부여하게 된 것입니다. 이 특권 세포가 바로 생식세포가 되는 것입니다. 이것도 크게 보면 점차 분화정도가 증가하는 생물 진화 경향의 일면일 것입니다. 이렇게 되자 재미있는 현상이 하나 생기게 되었습니다. 생식권한이 특정 세포에게 집중되자 생식을 한 후에 나머지 몸은 더 이상 존재가치가 없어지게 된 것입니다. 사라져 버려도 큰 문제가 안된다는 이야기지요. 이는 곧 “죽음”의 탄생을 의미합니다. 나아가 다세포생물의 연속성은 이제 오직 생식세포 즉 생식세포 유전자를 통해서만 보장받게 되었습니다. 이 유전자를 보존하고 다음 세대로 전달할 수만 있다면 어떤 상황도 용인되게 된 것입니다. 몸 전체의 파괴도 다른 몸을 위해 내 몸을 파괴하는 것도 유전자만 보전할 수 있다면 다 용인되는 것입니다. 저자는 이를 “이기적 유전자”의 탄생이라 말하고 있습니다. p339-340 참조

    책 내용과 직접적으로 관련된 것은 아니지만 외람되게 한마디 더 덧붙입니다.
    백북스에서 닉 레인의 “미토콘드리아”가 그렇게 많이 언급되었지만 유감스럽게도 제가 보기엔 단 한번도 저자의 저술의도가 제대로 전달된 적이 없는 것 같습니다. 제대로 읽어보신 분은 아시겠지만 닉 레인의 “미토콘드리아”는 결코 미토콘드리아에서 일어나고 있는 전자전달계를 통한 ATP 생성과정을 설명하고자 쓰여진 책이 아닙니다. 미토콘드리아를 읽고 이런 이야기만 한다면 이것은 이 책의 100분의 1도 이해하지 못한 것입니다. 하지만 이일준님이 주도하는 “닉 레인 소모임”에서는 이런 우를 범하지 않으리라 믿어 의심치 않습니다.

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